Famoronana sonia LncRNA vaovao mifandraika amin'ny hery fiarovana mba hamantarana ireo marary Adenocarcinoma sarakaty mampidi-doza sy tsy dia mampidi-doza | BMC Gastroenterology

Ny homamiadan'ny sarakaty dia iray amin'ireo fivontosana mahafaty indrindra eran-tany miaraka amin'ny vinavina ratsy. Noho izany, ilaina ny modely faminaniana marina mba hamantarana ireo marary mety ho voan'ny homamiadan'ny sarakaty mba hampifanaraka ny fitsaboana sy hanatsarana ny vinavinan'ireo marary ireo.
Nahazo ny angon-drakitra RNAseq an'ny Cancer Genome Atlas (TCGA) pancreatic adenocarcinoma (PAAD) avy amin'ny tahiry UCSC Xena izahay, namantatra ny lncRNA mifandraika amin'ny hery fiarovana (irlncRNA) tamin'ny alàlan'ny famakafakana ny fifandraisana, ary namantatra ny fahasamihafana misy eo amin'ny TCGA sy ny sela adenocarcinoma pancreatic ara-dalàna. DEirlncRNA) avy amin'ny TCGA sy ny fanehoana ny sela genotype (GTEx) amin'ny sela pancreatic. Natao ny famakafakana univariate sy lasso regression fanampiny mba hanamboarana modely famantarana ny faminaniana. Avy eo dia nokajianay ny velaran-tany eo ambanin'ny fiolahana ary namaritra ny sanda fanapahana tsara indrindra ho an'ny famantarana ireo marary voan'ny adenocarcinoma pancreatic avo lenta sy ambany risika. Mba hampitahana ny toetra ara-pitsaboana, ny fidiran'ny sela immune, ny tontolo iainana immunosuppressive, ary ny fanoherana ny chimiothérapie amin'ny marary voan'ny homamiadan'ny pancreas avo lenta sy ambany risika.
Nahita mpivady DEirlncRNA miisa 20 izahay ary nanangona marary araka ny sanda fanapahana tsara indrindra. Nasehonay fa ny modely famantarana ny faminaniana dia manana fahombiazana manan-danja amin'ny faminaniana ny vinavinan'ny marary voan'ny PAAD. Ny AUC amin'ny fiolahana ROC dia 0.905 ho an'ny vinavina 1 taona, 0.942 ho an'ny vinavina 2 taona, ary 0.966 ho an'ny vinavina 3 taona. Ireo marary atahorana ho voan'ny aretina dia manana tahan'ny fahavelomana ambany kokoa ary toetra ara-pitsaboana ratsy kokoa. Nasehonay ihany koa fa ireo marary atahorana ho voan'ny aretina dia tsy ampy hery fiarovana ary mety hampivelatra fanoherana ny fitsaboana amin'ny alalan'ny hery fiarovana. Ny fanombanana ny fanafody miady amin'ny homamiadana toy ny paclitaxel, sorafenib, ary erlotinib mifototra amin'ny fitaovana faminaniana amin'ny kajy dia mety ho mety amin'ny marary atahorana ho voan'ny PAAD.
Amin'ny ankapobeny, ny fanadihadianay dia nametraka modely vaovao momba ny mety ho voan'ny aretina mifototra amin'ny irlncRNA mifamatotra, izay naneho tombony azo avy amin'ny faminaniana amin'ny marary voan'ny homamiadan'ny sarakaty. Ny modely momba ny mety ho voan'ny aretina azo avy amin'ny faminaniana dia mety hanampy amin'ny fanavahana ireo marary voan'ny PAAD izay mety amin'ny fitsaboana.
Fivontosana mamoafady ny homamiadan'ny sarakaty izay tsy maharitra dimy taona ary avo lenta ny tahan'ny fahavelomana. Amin'ny fotoana anaovana ny fitiliana, ny ankamaroan'ny marary dia efa amin'ny dingana mandroso. Ao anatin'ny valan'aretina COVID-19, ny dokotera sy ny mpitsabo mpanampy dia eo ambany fanerena goavana rehefa mitsabo marary voan'ny homamiadan'ny sarakaty, ary ny fianakavian'ny marary dia miatrika fanerena maro ihany koa rehefa mandray fanapahan-kevitra momba ny fitsaboana [1, 2]. Na dia efa nisy fandrosoana lehibe aza teo amin'ny fitsaboana ny DOAD, toy ny fitsaboana neoadjuvant, ny fandidiana, ny fitsaboana amin'ny taratra, ny chimiothérapie, ny fitsaboana molekiola kendrena, ary ny immune checkpoint inhibitors (ICIs), dia eo amin'ny 9% eo ho eo amin'ny marary no velona dimy taona aorian'ny fitiliana [3]. ], 4]. Satria tsy mahazatra ny soritr'aretina voalohany amin'ny adenocarcinoma sarakaty, ny marary dia matetika voamarina fa manana metastasis amin'ny dingana mandroso [5]. Noho izany, ho an'ny marary iray, ny fitsaboana feno tsirairay dia tsy maintsy mandanja ny tombony sy ny fatiantoka amin'ny safidy fitsaboana rehetra, tsy vitan'ny hoe hanalava ny fahavelomana, fa koa mba hanatsarana ny kalitaon'ny fiainana [6]. Noho izany, ilaina ny modely faminaniana mahomby mba hanombanana tsara ny vinavinan'ny marary [7]. Noho izany, azo fidina ny fitsaboana sahaza mba handanjalanjana ny fahaveloman'ny marary voan'ny PAAD sy ny kalitaon'ny fiainany.
Ny vinavinan'ny PAAD ratsy dia vokatry ny fanoherana ny fanafody simika. Tato anatin'ny taona vitsivitsy, dia nampiasaina betsaka tamin'ny fitsaboana fivontosana mivaingana ny fanafody manakana ny fiarovana [8]. Na izany aza, mahalana vao mahomby ny fampiasana ICI amin'ny homamiadan'ny sarakaty [9]. Noho izany, zava-dehibe ny mamantatra ireo marary izay mety handray soa avy amin'ny fitsaboana ICI.
Ny ARN tsy misy kaody lava (lncRNA) dia karazana ARN tsy misy kaody miaraka amin'ny transcripts mihoatra ny 200 nucleotides. Miely patrana ny LncRNA ary mahaforona eo amin'ny 80% eo ho eo amin'ny transcriptome olombelona [10]. Betsaka ny asa no naneho fa ny modely prognostic mifototra amin'ny lncRNA dia afaka maminavina tsara ny prognostic an'ny marary [11, 12]. Ohatra, lncRNA mifandraika amin'ny autophagy 18 no hita fa mamorona sonia prognostic amin'ny homamiadan'ny nono [13]. LncRNA mifandraika amin'ny hery fiarovana enina hafa no nampiasaina mba hametrahana ny endri-javatra prognostic an'ny glioma [14].
Ao amin'ny homamiadan'ny sarakaty, misy fanadihadiana sasany nametraka sonia mifototra amin'ny lncRNA mba haminavina ny vinavinan'ny marary. Nisy sonia 3-lncRNA napetraka tao amin'ny adenocarcinoma sarakaty miaraka amin'ny velaran-tany eo ambanin'ny fiolahana ROC (AUC) 0.742 monja ary fahavelomana ankapobeny (OS) 3 taona [15]. Ankoatra izany, miovaova ny sandan'ny fanehoana lncRNA eo amin'ny genome samihafa, ny endrika angon-drakitra samihafa, ary ny marary samihafa, ary tsy marin-toerana ny fahombiazan'ny modely faminaniana. Noho izany, mampiasa algorithm modely vaovao, fampiarahana ary famerenana izahay, mba hamoronana sonia lncRNA (irlncRNA) mifandraika amin'ny hery fiarovana mba hamoronana modely faminaniana marina sy marin-toerana kokoa [8].
Ny angon-drakitra RNAseq voarindra (FPKM) sy ny angon-drakitra momba ny homamiadan'ny sarakaty klinika TCGA ary ny angon-drakitra momba ny fanehoana ny tavy genotype (GTEx) dia nalaina avy amin'ny tahiry UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/). Ny rakitra GTF dia nalaina avy amin'ny tahiry Ensembl (http://asia.ensembl.org) ary nampiasaina hanesorana ny mombamomba ny fanehoana lncRNA avy amin'ny RNAseq. Naka ireo fototarazo mifandraika amin'ny hery fiarovana avy amin'ny tahiry ImmPort (http://www.immport.org) izahay ary namantatra ireo lncRNA mifandraika amin'ny hery fiarovana (irlncRNA) tamin'ny alàlan'ny famakafakana ny fifandraisana (p < 0.001, r > 0.4). Famantarana ireo irlncRNA maneho fahasamihafana (DEirlncRNA) amin'ny alàlan'ny fampifangaroana ireo irlncRNA sy ireo lncRNA maneho fahasamihafana azo avy amin'ny tahiry GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) ao amin'ny cohort TCGA-PAAD (|logFC| > 1 sy FDR) <0.05).
Efa notaterina teo aloha ity fomba ity [8]. Indrindra indrindra, manorina X isika mba hanoloana ny lncRNA A sy lncRNA B mifampitohy. Rehefa ambony noho ny lncRNA B ny sandan'ny fanehoana ny lncRNA A, dia faritana ho 1 ny X, raha tsy izany dia faritana ho 0 ny X. Noho izany, afaka mahazo matrice 0 na – 1 isika. Ny axe mitsangana amin'ny matrice dia maneho ny santionany tsirairay, ary ny axe mitsivalana dia maneho ny mpivady DEirlncRNA tsirairay miaraka amin'ny sanda 0 na 1.
Nampiasaina handinihana ireo mpivady DEirlncRNA prognostika ny fanadihadiana regression univariate narahin'ny regression Lasso. Nampiasa fanamarinana miverimberina in-1000 (p < 0.05) ny fanadihadiana regression lasso, miaraka amin'ny fanentanana kisendrasendra 1000 isaky ny fihazakazahana. Rehefa nihoatra ny in-100 ny fatran'ny mpivady DEirlncRNA tsirairay tao anatin'ny tsingerina 1000, dia nofantenana ireo mpivady DEirlncRNA mba hanamboarana modely mety hampidi-doza prognostika. Avy eo dia nampiasa ny fiolahana AUC izahay mba hahitana ny sanda fanapahana tsara indrindra amin'ny fanasokajiana ireo marary PAAD ho vondrona manana risika ambony sy ambany. Nokajiana ihany koa ny sandan'ny AUC an'ny modely tsirairay ary naseho ho toy ny fiolahana. Raha mahatratra ny teboka avo indrindra izay manondro ny sandan'ny AUC ambony indrindra ny fiolahana, dia mijanona ny fizotran'ny kajy ary heverina ho kandidà tsara indrindra ny modely. Natsangana ireo modely fiolahana ROC 1, 3 ary 5 taona. Nampiasaina handinihana ny fahombiazan'ny faminaniana mahaleo tena an'ny modely mety hampidi-doza prognostika ny fanadihadiana regression univariate sy multivariate.
Mampiasa fitaovana fito handinihana ny tahan'ny fidiran'ny sela fiarovana, anisan'izany ny XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, ary CIBERSORT. Nalaina avy amin'ny tahiry TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3) ny angon-drakitra momba ny fidiran'ny sela fiarovana. Nohadihadiana tamin'ny fampiasana ny fitsapana Wilcoxon signed-rank ny fahasamihafan'ny votoatin'ny sela miaro amin'ny fiarovana eo amin'ireo vondrona manana risika ambony sy ambany amin'ny modely namboarina, ary aseho amin'ny grafika efamira ny valiny. Natao ny fanadihadiana momba ny fifandraisan'ny Spearman mba handinihana ny fifandraisana misy eo amin'ny sandan'ny isa mety hampidi-doza sy ny sela miaro amin'ny fiarovana. Aseho amin'ny endrika vatomamy ny coefficient fifandraisana vokatr'izany. Napetraka tamin'ny p < 0.05 ny tokonam-baravaran'ny dikany. Natao tamin'ny fampiasana ny fonosana R ggplot2 ny fomba fiasa. Mba handinihana ny fifandraisana misy eo amin'ny modely sy ny haavon'ny fanehoan-kevitry ny fototarazo mifandraika amin'ny tahan'ny fidiran'ny sela fiarovana, dia nanao ny fonosana ggstatsplot sy ny fijerena ny teti-drà violin izahay.
Mba hanombanana ireo lamina fitsaboana ara-pitsaboana ho an'ny homamiadan'ny sarakaty, dia nokajianay ny IC50 amin'ireo fanafody simika ampiasaina matetika ao amin'ny andiany TCGA-PAAD. Noharina tamin'ny fampiasana ny fitsapana Wilcoxon signed-rank ny fahasamihafan'ny fifantohana antsasaky ny inhibitory (IC50) eo amin'ireo vondrona avo lenta sy ambany risika, ary aseho amin'ny endrika boxplots novokarina tamin'ny fampiasana pRRophetic sy ggplot2 ao amin'ny R ny valiny. Mifanaraka amin'ny torolàlana sy fenitra mifandraika amin'izany ny fomba rehetra.
Aseho amin'ny Sary 1 ny fizotran'ny fikarohanay. Amin'ny fampiasana fanadihadiana momba ny fifandraisana misy eo amin'ny lncRNA sy ny fototarazo mifandraika amin'ny hery fiarovana, dia nifidy irlncRNA 724 izahay miaraka amin'ny p < 0.01 ary r > 0.4. Avy eo dia nodinihinay ireo lncRNA samihafa maneho ny GEPIA2 (Sary 2A). IrlncRNA miisa 223 no samy hafa maneho ny adenocarcinoma-n'ny sarakaty sy ny sela sarakaty ara-dalàna (|logFC| > 1, FDR < 0.05), antsoina hoe DEirlncRNA.
Fananganana modely faminaniana momba ny risika. (A) Tetika volkano misy lncRNA maneho fahasamihafana. (B) Fizarana ny coefficients lasso ho an'ny mpivady DEirlncRNA 20. (C) Fiovaovan'ny mety ho ampahany amin'ny fizarana coefficients LASSO. (D) Tetika ala mampiseho fanadihadiana regression univariate amin'ny mpivady DEirlncRNA 20.
Nanangana matrisa 0 na 1 izahay avy eo tamin'ny fampiarahana DEirlncRNA 223. Mpiara-dia DEirlncRNA miisa 13 687 no fantatra. Taorian'ny fanadihadiana univariate sy lasso regression, dia nosedraina ihany ny mpivady DEirlncRNA 20 mba hanamboarana modely prognostic risika (Sary 2B-D). Mifototra amin'ny valin'ny fanadihadiana Lasso sy regression marobe, dia nikajy ny isa risika ho an'ny marary tsirairay ao amin'ny cohort TCGA-PAAD izahay (Tabilao 1). Mifototra amin'ny valin'ny fanadihadiana lasso regression, dia nikajy ny isa risika ho an'ny marary tsirairay ao amin'ny cohort TCGA-PAAD izahay. Ny AUC amin'ny fiolahana ROC dia 0.905 ho an'ny vinavinan'ny modely risika 1 taona, 0.942 ho an'ny vinavina 2 taona, ary 0.966 ho an'ny vinavina 3 taona (Sary 3A-B). Nametraka sanda fetra tsara indrindra 3.105 izahay, nozaraina ho vondrona avo lenta sy ambany risika ireo marary TCGA-PAAD, ary nasehonay ny vokatra azo tamin'ny fahavelomana sy ny fizarana isa azo tamin'ny risika ho an'ny marary tsirairay (Sary 3C-E). Ny fanadihadiana Kaplan-Meier dia naneho fa ny fahaveloman'ireo marary PAAD tao amin'ny vondrona avo lenta dia ambany lavitra noho ny an'ireo marary tao amin'ny vondrona ambany risika (p < 0.001) (Sary 3F).
Ny maha-azo itokiana ireo modely momba ny risika ara-paminaniana. (A) ROC an'ny modely momba ny risika ara-paminaniana. (B) Modely momba ny risika ara-paminaniana ROC 1-, 2-, ary 3-taona. (C) ROC an'ny modely momba ny risika ara-paminaniana. Mampiseho ny teboka fanapahana tsara indrindra. (DE) Fizarana ny toetry ny fahavelomana (D) sy ny isa momba ny risika (E). (F) Fanadihadiana Kaplan-Meier momba ireo marary PAAD ao amin'ny vondrona misy risika ambony sy ambany.
Nandinika bebe kokoa ny fahasamihafan'ny isa azo avy amin'ny risika izahay araka ny toetra ara-pitsaboana. Ny tsipika miendrika tsipika (Sary 4A) dia mampiseho ny fifandraisana ankapobeny misy eo amin'ny toetra ara-pitsaboana sy ny isa azo avy amin'ny risika. Indrindra indrindra, ireo marary zokiolona dia nanana isa azo avy amin'ny risika ambony kokoa (Sary 4B). Ho fanampin'izany, ireo marary manana dingana II dia nanana isa azo avy amin'ny risika ambony kokoa noho ireo marary manana dingana I (Sary 4C). Momba ny ambaratongan'ny fivontosana amin'ny marary PAAD, ireo marary kilasy 3 dia nanana isa azo avy amin'ny risika ambony kokoa noho ireo marary kilasy 1 sy 2 (Sary 4D). Nanao fanadihadiana regression univariate sy multivariate ihany koa izahay ary nampiseho fa ny isa azo avy amin'ny risika (p < 0.001) sy ny taona (p = 0.045) dia anton-javatra faminaniana mahaleo tena amin'ny marary PAAD (Sary 5A-B). Ny fiolahana ROC dia nampiseho fa ny isa azo avy amin'ny risika dia ambony noho ny toetra ara-pitsaboana hafa amin'ny faminaniana ny fahaveloman'ny marary PAAD mandritra ny 1, 2, ary 3 taona (Sary 5C-E).
Toetra ara-pitsaboana amin'ny modely faminaniana ny mety ho loza. Ny histograma (A) dia mampiseho (B) taona, (C) dingana fivontosana, (D) ambaratongan'ny fivontosana, isa azo avy amin'ny risika, ary ny maha-lahy na maha-vavy ny marary ao amin'ny andiany TCGA-PAAD. **p < 0.01
Famakafakana mialoha tsy miankina amin'ny modely momba ny risika ara-prognostika. (AB) Famakafakana regression univariate (A) sy multivariate (B) momba ny modely momba ny risika ara-prognostika sy ny toetra ara-pitsaboana. (CE) ROC 1-, 2-, ary 3-taona ho an'ny modely momba ny risika ara-prognostika sy ny toetra ara-pitsaboana
Noho izany, nodinihinay ny fifandraisana misy eo amin'ny isa azo avy amin'ny fotoana sy ny risika. Hitanay fa ny isa azo avy amin'ny risika amin'ny marary PAAD dia mifandray mifanohitra amin'ny sela CD8+ T sy sela NK (Sary 6A), izay manondro ny fihenan'ny fiasan'ny hery fiarovana ao amin'ny vondrona risika avo lenta. Nodinihinay ihany koa ny fahasamihafan'ny fidiran'ny sela fiarovana eo amin'ny vondrona risika avo lenta sy ambany ary nahita vokatra mitovy (Sary 7). Vitsy kokoa ny fidiran'ny sela CD8+ T sy sela NK ao amin'ny vondrona risika avo lenta. Tato anatin'ny taona vitsivitsy, ny inhibitors immune checkpoint (ICIs) dia nampiasaina betsaka tamin'ny fitsaboana fivontosana mafy. Na izany aza, mahalana vao nahomby ny fampiasana ICI amin'ny homamiadan'ny sarakaty. Noho izany, nodinihinay ny fanehoana ny fototarazo immune checkpoint amin'ny vondrona risika avo lenta sy ambany. Hitanay fa ny CTLA-4 sy CD161 (KLRB1) dia be loatra tao amin'ny vondrona risika ambany (Sary 6B-G), izay manondro fa ny marary PAAD ao amin'ny vondrona risika ambany dia mety ho mora tohina amin'ny ICI.
Famakafakana ny fifandraisana misy eo amin'ny modely mety hampidi-doza mialoha sy ny fidiran'ny sela fiarovana. (A) Fifandraisana misy eo amin'ny modely mety hampidi-doza mialoha sy ny fidiran'ny sela fiarovana. (BG) Mampiseho ny fanehoan-kevitry ny fototarazo amin'ny vondrona misy risika ambony sy ambany. (HK) Sanda IC50 ho an'ny fanafody miady amin'ny homamiadana manokana amin'ny vondrona misy risika ambony sy ambany. *p < 0.05, **p < 0.01, ns = tsy manan-danja
Nodinihinay bebe kokoa ny fifandraisana misy eo amin'ny isa azo avy amin'ny risika sy ny akora simika mahazatra ao amin'ny andiany TCGA-PAAD. Nikaroka fanafody miady amin'ny homamiadana ampiasaina matetika amin'ny homamiadan'ny sarakaty izahay ary nandinika ny fahasamihafan'ny sandan'ny IC50 eo amin'ireo vondrona manana risika ambony sy ambany. Ny valiny dia naneho fa ny sandan'ny IC50 an'ny AZD.2281 (olaparib) dia ambony kokoa amin'ny vondrona manana risika ambony, izay midika fa ireo marary PAAD ao amin'ny vondrona manana risika ambony dia mety tsy ho voan'ny fitsaboana AZD.2281 (Sary 6H). Ankoatra izany, ny sandan'ny IC50 an'ny paclitaxel, sorafenib, ary erlotinib dia ambany kokoa amin'ny vondrona manana risika ambony (Sary 6I-K). Nahita fanafody miady amin'ny homamiadana 34 manana sandan'ny IC50 ambony kokoa izahay ao amin'ny vondrona manana risika ambony ary fanafody miady amin'ny homamiadana 34 manana sandan'ny IC50 ambany kokoa ao amin'ny vondrona manana risika ambony (Tabilao 2).
Tsy azo lavina fa misy betsaka ny lncRNA, mRNA, ary miRNA ary mitana anjara toerana lehibe amin'ny fivoaran'ny homamiadana. Misy porofo maro manohana ny anjara toerana lehibe amin'ny mRNA na miRNA amin'ny faminaniana ny fahavelomana amin'ny ankapobeny amin'ny karazana homamiadana maromaro. Tsy isalasalana fa maro amin'ireo modely momba ny risika ara-paminaniana no mifototra amin'ny lncRNA ihany koa. Ohatra, Luo et al. Ny fanadihadiana dia naneho fa ny LINC01094 dia mitana anjara toerana lehibe amin'ny fihanaky ny PC sy ny metastasis, ary ny fanehoana ambony ny LINC01094 dia manondro ny fahaveloman'ny marary homamiadan'ny sarakaty [16]. Ny fanadihadiana natolotr'i Lin et al. Ny fanadihadiana dia naneho fa ny fihenan'ny lncRNA FLVCR1-AS1 dia mifandray amin'ny vinavina ratsy amin'ny marary homamiadan'ny sarakaty [17]. Na izany aza, ny lncRNA mifandraika amin'ny hery fiarovana dia tsy dia resahina loatra amin'ny faminaniana ny fahaveloman'ny marary homamiadana amin'ny ankapobeny. Vao haingana, asa be dia be no nifantoka tamin'ny fananganana modely momba ny risika ara-paminaniana mba haminavina ny fahaveloman'ny marary homamiadana ary amin'izany dia hanitsiana ny fomba fitsaboana [18, 19, 20]. Mitombo ny fanekena ny anjara toerana lehibe amin'ny fidiran'ny hery fiarovana amin'ny fanombohana, ny fivoarana ary ny valin'ny fitsaboana toy ny chimiothérapie. Maro ireo fanadihadiana no nanamafy fa ny sela fiarovana miditra amin'ny fivontosana dia mitana anjara toerana lehibe amin'ny valin'ny chimiothérapie cytotoxic [21, 22, 23]. Ny tontolo iainana miaro amin'ny fivontosana dia anton-javatra manan-danja amin'ny fahaveloman'ny mararin'ny fivontosana [24, 25]. Ny fitsaboana amin'ny alalan'ny hery fiarovana, indrindra ny fitsaboana ICI, dia ampiasaina betsaka amin'ny fitsaboana fivontosana mafy [26]. Ny fototarazo mifandraika amin'ny hery fiarovana dia ampiasaina betsaka mba hanamboarana modely momba ny mety ho voan'ny kansera. Ohatra, Su et al. Ny modely momba ny mety ho voan'ny kansera mifandraika amin'ny hery fiarovana dia mifototra amin'ny fototarazo mpamoaka proteinina mba haminavina ny vinavinan'ny mararin'ny homamiadan'ny ovaire [27]. Ny fototarazo tsy mpamoaka toy ny lncRNA dia mety ihany koa amin'ny fananganana modely momba ny mety ho voan'ny kansera [28, 29, 30]. Luo et al. dia nanao fitiliana lncRNA mifandraika amin'ny hery fiarovana efatra ary nanangana modely faminaniana ho an'ny mety ho voan'ny kansera amin'ny vozon-tranonjaza [31]. Khan et al. Fandikana samihafa miisa 32 no voafaritra, ary mifototra amin'izany, dia napetraka ny modely faminaniana misy fandikana manan-danja 5, izay natolotra ho fitaovana tena atolotra ho an'ny faminaniana ny fandavana tampoka voaporofo tamin'ny biopsy taorian'ny famindrana voa [32].
Ny ankamaroan'ireo modely ireo dia mifototra amin'ny haavon'ny fanehoana fototarazo, na fototarazo mpamoaka proteinina na fototarazo tsy mpamoaka. Na izany aza, ny fototarazo iray ihany dia mety manana sanda fanehoana samihafa amin'ny genome, endrika angon-drakitra ary amin'ny marary samihafa, izay mitarika ho amin'ny tombana tsy marin-toerana amin'ny modely faminaniana. Ato amin'ity fandalinana ity, dia nanangana modely mitombina izahay miaraka amin'ny lncRNA roa tsiroaroa, tsy miankina amin'ny sanda fanehoana marina.
Ato amin'ity fandalinana ity, dia namantatra ny irlncRNA voalohany izahay tamin'ny alàlan'ny famakafakana fifandraisana amin'ny fototarazo mifandraika amin'ny hery fiarovana. Nojerenay ny DEirlncRNA 223 tamin'ny alàlan'ny hybridization tamin'ny lncRNA samy hafa fanehoana. Faharoa, nanangana matrix 0-na-1 izahay mifototra amin'ny fomba fampiarahana DEirlncRNA navoaka [31]. Avy eo dia nanao famakafakana regression univariate sy lasso izahay mba hamantarana ny mpivady DEirlncRNA prognostic ary nanangana modely risika mialoha. Nodinihinay bebe kokoa ny fifandraisana misy eo amin'ny isa risika sy ny toetran'ny klinika amin'ny marary voan'ny PAAD. Hitanay fa ny modely risika mialoha anay, amin'ny maha-antony mialoha ny marary PAAD, dia afaka manavaka tsara ny marary avo lenta amin'ny marary ambany lenta ary ny marary avo lenta amin'ny marary ambany lenta. Ho fanampin'izany, ny sandan'ny AUC amin'ny fiolahana ROC amin'ny modely risika mialoha dia 0.905 ho an'ny vinavina 1 taona, 0.942 ho an'ny vinavina 2 taona, ary 0.966 ho an'ny vinavina 3 taona.
Nitatitra ireo mpikaroka fa ireo marary manana fidiran'ny sela CD8+ T betsaka kokoa dia mora tohina kokoa amin'ny fitsaboana ICI [33]. Ny fitomboan'ny isan'ny sela cytotoxic, sela CD56 NK, sela NK ary sela CD8+ T ao amin'ny tontolo iainana miaro amin'ny fivontosana dia mety ho iray amin'ireo antony mahatonga ny fiantraikan'ny fampihenana ny fivontosana [34]. Ny fanadihadiana teo aloha dia naneho fa ny haavon'ny fidiran'ny CD4(+) T sy CD8(+) T betsaka kokoa dia mifandray betsaka amin'ny fahavelomana lava kokoa [35]. Ny fidiran'ny sela CD8 T tsy ampy, ny fihenan'ny neoantigen, ary ny tontolo iainana miaro amin'ny fivontosana dia mitarika ho amin'ny tsy fahampian'ny valinteny amin'ny fitsaboana ICI [36]. Hitanay fa ny isa mety hampidi-doza dia mifandray ratsy amin'ny sela CD8+ T sy sela NK, izay manondro fa ireo marary manana isa mety hampidi-doza betsaka dia mety tsy ho mety amin'ny fitsaboana ICI ary manana vinavina ratsy kokoa.
Ny CD161 dia mariky ny sela mpamono voajanahary (NK). Ny sela T CD8+CD161+ CAR-transduced dia mampitombo ny fahombiazan'ny antitumor in vivo amin'ny modely xenograft adenocarcinoma ductal pancreatic HER2+ [37]. Ny inhibitors immune checkpoint dia mikendry ny cytotoxic T lymphocyte associated protein 4 (CTLA-4) sy ny programmed cell death protein 1 (PD-1)/programmed cell death ligand 1 (PD-L1) ary manana fahafahana lehibe amin'ny sehatra maro. Ny fanehoana ny CTLA-4 sy CD161 (KLRB1) dia ambany kokoa amin'ny vondrona avo lenta, izay manondro bebe kokoa fa ny marary manana isa avo lenta dia mety tsy ho afaka hahazo fitsaboana ICI. [38]
Mba hahitana safidy fitsaboana mety amin'ny marary atahorana ho voan'ny PAAD, dia nodinihinay ireo fanafody miady amin'ny homamiadana isan-karazany ary hitanay fa ny paclitaxel, sorafenib, ary erlotinib, izay ampiasaina betsaka amin'ny marary PAAD, dia mety ho mety amin'ny marary atahorana ho voan'ny PAAD. [33]. Zhang et al. dia nahita fa ny fiovan'ny ADN (DDR) amin'ny lalan'ny valin'ny fahasimban'ny ADN (DDR) dia mety hiteraka vinavina ratsy amin'ny marary homamiadan'ny prostaty [39]. Ny fitsapana Olaparib Ongoing homamiadan'ny pancreas (POLO) dia naneho fa ny fitsaboana fikojakojana amin'ny olaparib dia naharitra ela kokoa ny fahavelomana tsy misy fivoarana raha oharina amin'ny placebo taorian'ny chimiothérapie miorina amin'ny platinum voalohany amin'ny marary voan'ny adenocarcinoma ductal pancreatic sy ny fiovan'ny germline BRCA1/2 [40]. Izany dia manome fanantenana lehibe fa hihatsara be ny vokatra fitsaboana amin'ity vondron'olona marary ity. Ato amin'ity fandalinana ity, ny sandan'ny IC50 an'ny AZD.2281 (olaparib) dia ambony kokoa amin'ny vondrona atahorana ho voan'ny PAAD, izay manondro fa ny marary PAAD ao amin'ny vondrona atahorana ho voan'ny PAAD dia mety ho mahatohitra ny fitsaboana amin'ny AZD.2281.
Ireo maodely vinavina ato amin'ity fanadihadiana ity dia mamokatra vokatra vinavina tsara, saingy mifototra amin'ny vinavina analytika izy ireo. Ny fomba hanamafisana ireo vokatra ireo amin'ny angon-drakitra ara-pitsaboana dia fanontaniana manan-danja. Ny ultrasonografia endoskopika amin'ny fanjaitra manify (EUS-FNA) dia lasa fomba tsy azo ihodivirana amin'ny famaritana ny lesoka amin'ny pancreas mivaingana sy ivelan'ny sarakaty miaraka amin'ny fahatsapana 85% ary ny specificity 98% [41]. Ny fisian'ny fanjaitra biopsy fanjaitra manify EUS (EUS-FNB) dia mifototra indrindra amin'ny tombony azo avy amin'ny FNA, toy ny fahamarinan'ny diagnostika ambony kokoa, ny fahazoana santionany izay miaro ny rafitra histolojika, ary noho izany dia mamorona sela fiarovana izay tena ilaina amin'ny diagnostika sasany. fandokoana manokana [42]. Ny famerenana rafitra ny literatiora dia nanamafy fa ny fanjaitra FNB (indrindra ny 22G) dia mampiseho ny fahombiazana ambony indrindra amin'ny fanangonana sela avy amin'ny sarakaty [43]. Ara-pitsaboana, vitsy ny marary afaka manao fandidiana radikal, ary ny ankamaroan'ny marary dia manana fivontosana tsy azo didiana amin'ny fotoana fitiliana voalohany. Amin'ny fampiharana ara-pitsaboana, vitsy ny marary afaka manao fandidiana radikal satria ny ankamaroan'ny marary dia manana fivontosana tsy azo didiana amin'ny fotoana fitiliana voalohany. Aorian'ny fanamafisana ny aretina amin'ny alalan'ny EUS-FNB sy fomba hafa, dia matetika no fidiana ny fitsaboana tsy misy fandidiana manara-penitra toy ny chimiothérapie. Ny fandaharan'asa fikarohana manaraka ataonay dia ny fitsapana ny modely faminaniana amin'ity fandalinana ity amin'ny andiany fandidiana sy tsy misy fandidiana amin'ny alàlan'ny fanadihadiana miverina.
Amin'ny ankapobeny, ny fanadihadianay dia nametraka modely vaovao momba ny mety ho voan'ny aretina mifototra amin'ny irlncRNA mifamatotra, izay naneho tombony azo avy amin'ny faminaniana amin'ny marary voan'ny homamiadan'ny sarakaty. Ny modely momba ny mety ho voan'ny aretina azo avy amin'ny faminaniana dia mety hanampy amin'ny fanavahana ireo marary voan'ny PAAD izay mety amin'ny fitsaboana.
Azo alaina avy amin'ny mpanoratra mifandraika amin'izany raha misy fangatahana ara-drariny ireo angon-drakitra nampiasaina sy nohadihadiana tamin'ity fanadihadiana ity.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Ny anjara asan'ny fahaiza-miaina amin'ny fanelanelanana amin'ny fandrindrana ara-pihetseham-po ny fihetseham-po ratsy mandritra ny valan'aretina COVID-19: fanadihadiana miampita fizarana. Int J Ment Health Nurs [lahatsoratra an-gazety]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al. Ny hevitry ny mpianakavy momba ny fandraisana fanapahan-kevitra hafa ao amin'ny sampana fitsaboana vonjy taitra: famerenana rafitra. INT J NURS STUD [lahatsoratra amin'ny gazety; famerenana]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Homamiadan'ny sarakaty. Lancet. [Lahatsoratra an-gazety; fanohanana fikarohana, NIH, ivelan'ny sekoly; fanohanana fikarohana, governemanta ivelan'i Etazonia; famerenana]. 13/08/2011 2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemiolojian'ny homamiadan'ny sarakaty. Gazety Iraisam-pirenena momba ny Gastroenterology. [Lahatsoratra an-gazety, famerenana]. 2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nomôgrama vaovao mifandraika amin'ny tp53 mba haminavina ny fahavelomana amin'ny ankapobeny amin'ny marary voan'ny homamiadan'ny sarakaty. BMC Cancer [lahatsoratra an-gazety]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Fiantraikan'ny fitsaboana mifantoka amin'ny vahaolana amin'ny havizanana mifandraika amin'ny homamiadana amin'ny mararin'ny homamiadan'ny tsinaibe mandray chimiothérapie: fitsapana voafehy kisendrasendra. Mpitsabo mpanampy homamiadana. [Lahatsoratra an-gazety; fitsapana voafehy kisendrasendra; tohanan'ny governemanta ivelan'i Etazonia ny fanadihadiana]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al. Ny haavon'ny antigen carcinoembryonic (CEA) aorian'ny fandidiana dia maminavina ny vokatra aorian'ny fandidiana homamiadan'ny tsinaibe amin'ny marary manana haavon'ny CEA ara-dalàna alohan'ny fandidiana. Foibe ho an'ny Fikarohana momba ny Homamiadan'ny Fandikana. [Lahatsoratra an-gazety]. 01.01.2020 2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al. Ny lncRNA mifandraika amin'ny hery fiarovana dia mamorona marika vaovao ary maminavina ny tontolon'ny hery fiarovana amin'ny homamiadan'ny aty. Mol Ther Asidra nokleika [Lahatsoratra an-gazety]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Fitsaboana amin'ny alalan'ny hery fiarovana ho an'ny homamiadan'ny sarakaty: sakana sy fandrosoana. Ann, mpandidy tsinay [Lahatsoratra ao amin'ny Gazety; famerenana]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. ARN tsy misy kaody lava (LncRNA), genomika momba ny fivontosana virosy ary fisehoan-javatra mampitohy tsy ara-dalàna: fiantraikany ara-pahasalamana. AM J CANCER RES [lahatsoratra an-gazety; famerenana]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Famantarana ny sonia lncRNA mifandraika amin'ny vinavinan'ny homamiadan'ny endometrium. Zava-bitan'ny siansa [lahatsoratra ao amin'ny gazetiboky]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al. Fanadihadiana feno momba ny fototarazo faminaniana momba ny proteinina mifamatotra amin'ny RNA sy ireo kandidà fanafody amin'ny homamiadan'ny sela papillary renal. pregen. [Lahatsoratra ao amin'ny gazety]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al. Ny toetran'ny ARN lava tsy misy kaody mifandraika amin'ny autophagy dia maminavina ny vinavinan'ny homamiadan'ny nono. pregen. [Lahatsoratra ao amin'ny gazety]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Ny sonia lncRNA enina mifandraika amin'ny hery fiarovana dia manatsara ny vinavinan'ny aretina amin'ny glioblastoma multiforme. MOL Neurobiology. [Lahatsoratra an-gazety]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al. Sonian'ny tri-lncRNA vaovao maminavina ny fahaveloman'ny marary voan'ny homamiadan'ny sarakaty. SOLONTENIN'NY ONKOL. [Lahatsoratra an-gazety]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 dia mampiroborobo ny fivoaran'ny homamiadan'ny sarakaty amin'ny alàlan'ny fanaraha-maso ny fanehoana LIN28B sy ny lalan'ny PI3K/AKT amin'ny alàlan'ny sponged miR-577. Mol Therapeutics – Asidra nokleika. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al. Ny valin-kafatra tsara eo amin'ny lncRNA FLVCR1-AS1 sy KLF10 dia mety hanakana ny fivoaran'ny homamiadan'ny sarakaty amin'ny alàlan'ny lalan'ny PTEN/AKT. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Famantarana ireo fototarazo telo ambin'ny folo izay maminavina ny fahavelomana amin'ny ankapobeny amin'ny homamiadan'ny aty. Biosci Rep [lahatsoratra an-gazety]. 2021 04/09/2021.


Fotoana fandefasana: 22 Septambra 2023